O conselho Profissional da SBPRJ, parte constitutiva do Conselho Diretor, é responsável por todas as questões relacionadas ao exercício da profissão, com a responsabilidade de zelar pelos interesses, direitos e deveres dos psicanalistas, tanto internamente, quanto em nível nacional.

Além de suas funções precípuas, o Conselho Profissional propõe a criação de grupos de reflexão composto por alunos e membros interessados no estudo da ética, nas vertentes metapsicológica, social,  filosófica e  jurídica.